Её отец - Виллиам Мебарак (William Mebarak) (араб по национальности), её мать - Нидия Риполл (Nidia Ripoll), договорились крестить дочь под именем Шакира (Shakira), по-арабски это означает «Женщина переполненная благодатью», а на языке хинди «Богиня света». Полное имя Шакиры - Shakira Isabel Mebarak Ripoll.
Детство Шакиры прошло в одном из районов Барранкильи, в апартаментах Эль Лемонсито. К ней приходили старшие братья, сыновья дона Виллиама от первого брака, чтобы поиграть с малышкой, которая была очень шустрой. Шакира растёт в окружении книг, драгоценных камней и музыкальных ритмов. Её отец был не только писателем, но и владел ювелирным магазином, одним из самых популярных в городе, на Сан Блас. Вскоре Шакира проявила интерес к музыке и литературе.
Когда ей исполнилось 18 месяцев она знала алфавит...
Только в 8 лет родители разглядели в ней певицу.Когда ей исполнилось 18 месяцев, она знала алфавит, в 3 года умела читать и писать, в 4 была готова идти в школу. Но косность структуры образования не позволила ей этого сделать. На следующий год были проведены специальные экзамены, и специалисты заявили, что Шакира - гений (вундеркинд). В начале мать думала, что её дочь станет художником, т.к. она много рисовала, или писателем, потому что в 4 года она сочиняла стихи. В школе ей пророчили будущее звезды балета или просто современного танца, т.к. она часто танцевала перед одноклассниками танец живота. Только в 8 лет родители разглядели в ней певицу. В этом возрасте она написала песню «Твои темные очки» (Tus gafas oscuras) под впечатлением оптики дона Виллиама. Одаренность и исключительные способности не отразились на её детстве. «Помню как я играла в полицейских и бандитов с соседями. Я была главарём.» Сегодня она говорит, что в этих мужских играх у нее выработался характер лидера, победителя. Шакира была не просто талантлива, но и очень красива, она выиграла конкурс «Дитя Атлантики».